根据国务院批准的《2009年关税实施方案》，海关总署于2008年12月30日发布了中华人民共和国海关总署2008年第98号公告，其中规定对原产于包括菲律宾在内的东盟国家的部分税目的商品继续实施2009年中国-东盟自由贸易协定税率。现经国务院批准，自2009年7月1日起，对原产于菲律宾的部分税目商品实施2007年中国-东盟自由贸易协定税率（详见附件），不再实施2009年中国-东盟自由贸易协定税率。
《中国-东盟自贸区2007年协定税率表（菲律宾）》使用了简化的商品名称，其范围与2009年《中华人民共和国进出口税则》中相应税号的货品一致。
本公告内容自2009年7月1日起执行。
| 税则号列 | 商品名称（简称) | 2009年最惠国税率（%） | 协定税率（%）（菲律宾） |
| 28053011 | 钕 | 5.5 | 5 |
| 28053012 | 镝 | 5.5 | 5 |
| 28053013 | 铽 | 5.5 | 5 |
| 28053019 | 其他未相互混合或熔合的稀土金属、钪及钇 | 5.5 | 5 |
| 28053021 | 已相互混合或熔合的稀土金属、钪及钇，电池级 | 5.5 | 5 |
| 28053029 | 其他已相互混合或熔合的稀土金属、钪及钇 | 5.5 | 5 |
| 28164000 | 锶或钡的氧化物、氢氧化物及过氧化物 | 5.5 | 5 |
| 28461010 | 氧化铈 | 5.5 | 5 |
| 28461020 | 氢氧化铈 | 5.5 | 5 |
| 28461030 | 碳酸铈 | 5.5 | 5 |
| 28461090 | 铈的其他化合物 | 5.5 | 5 |
| 28469011 | 氧化钇 | 5.5 | 5 |
| 28469012 | 氧化镧 | 5.5 | 5 |
| 28469013 | 氧化钕 | 5.5 | 5 |
| 28469014 | 氧化铕 | 5.5 | 5 |
| 28469015 | 氧化镝 | 5.5 | 5 |
| 28469016 | 氧化铽 | 5.5 | 5 |
| 28469019 | 其他氧化稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469021 | 氯化铽 | 5.5 | 5 |
| 28469022 | 氯化镝 | 5.5 | 5 |
| 28469028 | 混合氯化稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469029 | 未混合氯化稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469030 | 氟化稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469041 | 碳酸镧 | 5.5 | 5 |
| 28469042 | 碳酸铽 | 5.5 | 5 |
| 28469043 | 碳酸镝 | 5.5 | 5 |
| 28469048 | 混合碳酸稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469049 | 未混合碳酸稀土 | 5.5 | 5 |
| 28469090 | 稀土金属、钇、钪的其他化合物 | 5.5 | 5 |